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STR检测服务来分析分析STR的原理
发布时间:2017-11-20   点击次数:956次
   STR检测服务来分析分析STR的原理
  短串联重复序列(short tandem repeat, STR),也称微卫星 DNA(microsalite DNA) ,是由2 - 6个碱基对作为核心单位,串联重复形成的一类DNA序列,由于核心单位重复数目在个体间呈高度变异性并且数量丰富,构成了STR基因座的遗传多态性。它分布于人类整个基因组,平均每15 kb就存在一个STR基因座。人类基因组内已发现了七千个以上的STR位点。它具有分布广泛,易于检测,信息量大,有高度多态性并遵循孟德尔共显性遗传等优点。是继限制性片段长度多态性 (RFLP) 之后的第二代遗传记,目前STR分析已广泛应用于遗传制图、连锁性分析、法医学鉴定、疾病基因定位、物种多态性和遗传病的诊断等诸多领域。
  微卫星(STR)检测服务流程
  1. 客户提供
  A.如果提供基因组DNA:至少提供100 ng DNA样品(针对每个多态性位点,需样品3-5 ul,浓度为30 - 50 ng/ul)
  B.如果提供PCR产物:产物要通过预实验的电泳检测,特异性要好
  C.如果需要设计引物,请提供目的片段序列或者微卫星检测位点,引物设计好后需要客户确认。
  D.除提供样品类型,DNA浓度和纯度值外,还需要注明可能残留的抑制剂成分。样品溶解在ddH2O中,如果不是,请注明溶解液成分。
  2. 确定STR位点,设计实验方案,包括荧光标记的选择,引物的设计、合成和标记,荧光分子量内标的选用等。
  3. 按照所设计的实验方案完成荧光PCR,利用琼脂糖电泳检测结果;若PCR产物特异性不够,将进行优化。
  4. PCR产物通过ABI 3730XL 测序仪器进行毛细管电泳检测,获得扩增片段大小的数据
  5. 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等软件对收集到的数据进行处理分析,将产物片段大小、数量多少的信息转化成直观准确的波形图谱,为下一步进行关联分析或连锁分析等遗传分析提供可靠的数据。
  6.发送准确的微卫星(STR)分型结果报告及PCR产物。

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