实时荧光定量PCR技术(Real Time Quantitative PCR)
在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,zui后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
相对定量应用(Relative Quantification,RQ)
特异性荧光标记:
TaqMan法
TaqMan探针的特性:
(1)5′端标记有报告基团(Reporter, R),如FAM、VIC等
(2)3′端标记有荧光淬灭基团 (Quencher, Q)
(3)探针完整,R所发射的荧光能量被Q基团吸收 ,无荧光, R与Q分开,发荧光
(4)Taq酶有 5′→3′外切核酸酶活性,可水解探针
相对定量通过内标定量:
内标(Endogenous Control)通常是β-actin、GAPDH基因等看家基因,在细胞中的表达量或在基因组中的拷贝数恒定,受环境因素影响小,内标定量结果代表了样本中所含细胞或基因组数量。
相对定量分析方法 :
2-ΔΔCt
前提:目标序列和内参序列的扩增效率接近100%且偏差在5%以内
1、用内参基因的CT值归一目标基因的CT值:
ΔCT(test)= CT(target,test)-CT(ref,test)
ΔCT(calibrator)= CT(target,calibrator)-CT(ref, calibrator)
2、用校准样本的ΔCT值归一试验样本的ΔCT值:
ΔΔCT= ΔCT(test) - ΔCT(calibrator)
3、计算表达水平比率:
2 –ΔΔCT=表达量的比值
服务流程:
步骤 | 客 户 提 供 | 服 务 内 容 | 基 屹 提 供 |
1 | 新鲜的且尽量多的材料;已知的全长基因序列;尽可能详细的背景资料:DNA/ RNA来源、丰度等。 | DNA/RNA提取,根据基因序列设计特异性的引物和荧光探针。 | |
2 | 纯化好的DNA/RNA(大于5 ug/样品);已知的全长基因序列;尽可能详细的背景资料:DNA/ RNA来源、丰度等。 | 根据基因序列设计特异性的引物和荧光探针。 | |
3 | 以DNA为模板,对目的基因进行荧光定量PCR检测分析 | 提供完整的定量分析结果、实验荧光定量扩增曲线及详细的实验步骤。 |
注意:客户可根据所能提供的起始材料不同,选择从步骤1或2启动项目。